发酵过程注意适当供氧与翻堆（温度升至75℃或以上时要翻倒几次），升温控制在65℃左右，温度太高对发酵物有影响。
翻抛机可对物料打散、粉碎，并带走部分水分 。 即可在开阔场地，也可在车间大棚中实施作业。该机一大技术突破在于整合了物料发酵后期的破碎功能，同时在翻拌的同时有氧气会进入，加快发酵，减少臭味。
高温中，鸡粪里的病菌、虫卵会被杀死，大分子蛋白分解成利于农作物吸收的小分子蛋白。生物发酵过程中可以有效的防止粪便里硫化氢、胺气、吲哚等有害、恶臭气体的产生，完全除去鸡粪中的臭味。 随着高温、翻堆，原料里的水分会逐渐降低，一般的发酵周期是12-15天，发酵完成，就可以收堆了，水分也降至35%左右。可以继续下一步的深加工，筛分、粉碎、造粒等。
有机肥翻堆机整机动力均衡适宜、耗能低、产量大，降低了生物有机肥生产成本。