冷却塔为多生物体的生长和培养提供了理想的环境，非使用期间（冬季停留）加剧了这个问题，尽管一致的杀菌剂计划可以降低风险，但最好的做法是每年冷却塔至少两次，通常情况下，这种维护将在冷却季节开始时和秋季停机后的初始启动之前进行。
冷却塔填料清洗方法 1、临时用塑料布搭建一个大水池； 2、将清洗剂加入清水中； 3、将填料从冷却塔中拆下来放入药池中浸泡； 4、将浸泡干净的填料用清水冲洗干净后装回冷却塔； 5、用粘有药剂的布放在冷却塔补水器上，将补水器口浸泡疏通； 6、用同样的方法将冷却塔底盘水垢进行清除干净； 7、用清水冲洗填料及塔身内外； 8、恢复系统各处，补水即可使用； 9、清洗完后给业主出清洗报告。
开放式冷却塔
1、被冷却介质在开式系统中循环，循环介质因蒸发而浓缩，须常年加药、补水，而且由于被冷却介质直接接触空气，容易被污染，当遇到硫化天时，流体发生酸性反应，造成相联设备损坏。
2、须经常停机保养维护，不适合需要连续运转的系统。
3、被冷却介质开式运行，受太阳光照射，容易产生藻类和盐类结晶，从而影响系统的使用性能。
4、无法进行干式运行
5、当流体为挥发性、毒性、刺激性溶液时，使用开放式冷却塔运行模式存在安全隐患。
6、被冷却介质在开式中循环，系统管道以及被冷却设备换热器易结垢，降低被冷却设备的换热效率，增加系统的运行费用。
停机清洗
即按照清洗流程杀菌灭藻清洗—-清洗除垢剂清洗—-预膜—-清洗后的清理。此方案需要在停机状态下进行清洗时间8天左右，除垢率95%以上。
清洗程序：水冲洗—杀菌灭藻清洗——清洗剂除垢清洗——清洗后冲洗——预膜——清洗后的清理。