首先通常我们用的交流电源电压一根线和大地相连，另一根线与大地之间有220V的电位差。人接触会产生触电。而隔离变压器的次级不与大地相连，它的任意两线与大地之间没有电位差。人接触任意一条线都不会发生触电，这样就比较安全。
其次，隔离变压器的输出端跟输入端是完全“断路”隔离的，这样就有效的对变压器的输入端（电网供给的电源电压）起到了一个良好的过滤作用。从而给用电设备提供了纯净的电源电压。
另一用途是防干扰。可广泛用于地铁、高层建筑、机场、车站、码头、工矿企业及隧道的输配电等场所。
三重屏蔽的隔离变压器当需要更高隔离要求的时候，可选用三重屏蔽的隔离变压器。三种不同屏蔽层的连接方法取决于变压器的安装方法以及接地条件。一般将变压器安装在设备机架的隔板或屏蔽室的隔墙上，并将机架接设备安全地线，输入电源安全地被断开加绝缘管保护。
用隔离变压器首先了解了我国的供电系统。我国的供电系统在向低压用户供电时，一般采用三相四线制，中性线接地，共点为居民住宅的电线，一条是相线(带电线)，另一条是零线，与地处于同一位置，当人体触碰热底板时，会引起电流通过人体和地球形成一个回路，从而造成电击危险，如果使用隔离变压器，电击危险是安全的。由于第一次和第二次是在没有物理硬连接的情况下通过磁场交换能量的能量，即使人体接触到带电物品，人体和地球也处于同一位置，活部分的潜力很低，不会造成电击危险。使用隔离变压器注意两点。
隔离式三相隔离变压器基于电磁感应原理。它内部包含两组线圈，在交流电的作用下形成磁场。在磁场的作用下，次级绕组可以产生电磁感应电动势。如果三相隔离变压器的次级绕组驱动负载，则会产生大量的感应电流。由于隔离式三相隔离变压器的次级绕组的匝数与初级绕组的匝数不同，隔离式三相隔离变压器的电压变换是通过调整次级侧的匝数来实现的。