在大自然中，野生黑豚鼠是强者，它们祖祖代代生活在大自然的深山丛林、大树、竹根下或灌木丛中， 以洞为居。野生黑豚鼠由于体小力好，为了躲避豹、狼、狐、鹰、鸳等猛兽猛禽的袭击，常常只能偷偷摸摸觅食，觅食一会儿，又只能躲藏起来，肚子饿了又偷偷出来觅食；长期整日反复，便养成了昼夜行动的习性。
黑豚鼠性情非常温顺。母兔产仔或带仔时， 出于它的母性行为，捕捉时有时会主动伤人。而黑豚鼠既不会咬人，也不会抓人。它惟一的反抗就是”逃跑”。人捕捉时只发出小的叫声，抓上手后，不再发出叫声。黑豚鼠的耳朵及四肢短小，不善跳跃，也不能攀登，只要舍池、舍圈、笼舍高上40厘米，它就乖乖躲在里面。在安静的情况下，突然的响声、人与其他动物的闯人都会引起黑它的骚动和惊恐。由于它的性情温顺，许多人将它当宠物饲养。
不再存在于它们的野生原生草原栖息地。然而，在它们灭绝之前，它们非常适应并且能够在各种环境中生存。例如，他们可以生活在广阔的海拔范围内，从海平面到4000米。虽然研究表明它们不能在极端炎热或寒冷的环境中生存，但豚鼠可以承受从白天22˚C到夜间-7˚C的大范围温度。
豚鼠喜群居，有抓人的习惯，不喜攀登和跳跃，习性温顺，胆小易惊，有时发出吱吱的尖叫声，喜干燥清洁的生活环境。其活动、休息、采食多呈集体行为，休息时紧挨躺卧，单笼饲养时易发生足底溃疡。群体中有专制型社会行为，1～2只雄鼠处于统治地位，一雄多雌的群体形成明显的稳定性。