黑豚鼠拥有黑色的耳朵、黑色的眼睛、黑色的脚趾、油光发亮的黑色毛皮，它身形短粗、头圆大、颈短、无尾、耳朵和四肢短小、眼睛明亮，耳壳薄而血管鲜红明显，上唇分裂。门齿呈弓形深入颌部，咀嚼面锐利， 能终身生长。当咬合不正时，门齿臼齿会过度生长。黑豚鼠嚼肌发达。前肢有四趾，后肢有三趾，每趾都有突起的大趾甲，趾上的爪短而锐利，不抓人，不善攀登和跳跃。脚形似豚，体长225～355mm。被毛紧贴体表。
黑豚鼠听觉非常发达，能识别多种不同的声音，它听到的音域远大于人。当有尖锐的声音刺激时，常表现为耳廓微动以应答，即听觉耳动反射。听觉耳动反射减弱或缺失是听觉机能很好的表现。
新生黑豚鼠的体重与双亲的遗传特征、母体的营养、窝间距、一窝产仔数和妊娠期的长短有关。一般为50～115g。产仔数5只以上时仔鼠往往因体质太弱，体重太小而难以成活。
由于黑豚鼠妊娠期长，新生仔鼠出生后即能活动，全身覆有被毛，有门齿，眼耳已张开，数小时后即能采食软料。生长发育较快，在出生后两个月内平均每天增重4～5g 。一般二月龄黑豚鼠体重可达350克；五月龄雌鼠体重可达700克，雄鼠体重可达750克； 成年雄鼠体重可达950g，成年雌鼠体重可达800g。豚鼠寿命一般为4～5年。
不再存在于它们的野生原生草原栖息地。然而，在它们灭绝之前，它们非常适应并且能够在各种环境中生存。例如，他们可以生活在广阔的海拔范围内，从海平面到4000米。虽然研究表明它们不能在极端炎热或寒冷的环境中生存，但豚鼠可以承受从白天22˚C到夜间-7˚C的大范围温度。