一、提供车辆运输服务的税务筹划
“营改增”对物流企业经营决策的影响，体现在营业税和增值税对企业决策成本计量的核算方式不同。
例如：位于试点地区的一家物流企业C被认定为增值税一般纳税人，其汽车运输供应商S1、S2分别位于试点地区和非试点地区，假设2013年1月两家供应商均向C公司提供不含税价格100万元的运输服务，那么：对于S1供应商，C需要支付的价税合计金额为：100+100×11%=100+11=111万元其中，100万元计入成本，11万元可以凭增值税专用作为进项税额抵扣，由于增值税是价外税，所以相应的进项税额不能计入成本费用。
对于S2供应商，C需要支付的金额为：
100+100÷（1-3%）×3%=103.09万元在此情形下，实际支付的103.09万元都可以计入相关成本费用。
即两个供应商对C公司 的报价分别是111万元和103.09万元。从表面上看，S2供应商的报价更低，但由于增值税抵税的核算方式，实际上选择S1供应商更有优势，只是需要C公司预支待抵扣的增值税款而已，企业可以结合自身的现金持有政策做出抉择。
二、提供仓储服务的税务筹划
财税〔2011〕111号文件对纳入“营改增”范围的仓储服务定义为：“利用仓库、货场或者其他场所代客贮放、保管货物的业务活动”。而在现实的操作过程中，物流企业应当严格区分两类合同：仓储保管合同和仓库出租合同。
两项业务都属于仓储服务，但是仓库出租同时又属于不动产出租，属于营业税的征税范围，这就为税收筹划提供了空间。“营改增”试点并没有将不动产出租纳入试点范围，即其仍然按照5%的税率缴纳营业税。
如试点地区一物流企业D被认定为增值税一般纳税人，将自有的仓库出租给其他企业，拟收取价税合计200万元。
如果选择按照仓储业务缴纳增值税，则D企业实际能得到200-200÷（1+6%）×0.06=200-11.32=188.68万元。
如果选择按出租不动产缴纳营业税，则实际能得到200-200×5%=190万元。
显然选择缴纳营业税对D企业更有利。针对仓储服务进行税收筹划要提防筹划风险，在合同中明确规定双方的权利和义务，因为一般情况下，仓储业务负有更大责任，因此企业应结合自身经营情况准确筹划。
三、租赁物流设备（动产）的税务筹划
此类筹划主要是针对物流企业在“营改增”试点前发生的动产租赁业务，财税〔2011〕111号文件称之为“跨年度租赁”：即试点纳税人在该地区试点实施之日前签订的尚未执行完毕的租赁合同，在合同到期日之前继续按照现行营业税政策规定缴纳营业税。签订合同的日期对企业承担的税负具有很重要的决定性作用。
如试点地区的一家物流企业E为一般纳税人，该公司在2012年1月与另一家企业签订3年的设备租赁合同，合同金额30万元（平均每年10万元）。
如果一次性签订3年的合同，则按照租赁业5%的税率缴纳营业税：E企业应缴纳营业税额=30×5%=1.5万元；企业实际得到30-1.5=28.5万元。
如果每年签订一次，按照“营改增”相关规定，租赁合同为试点开始日后签订执行，合同标的物为试点前购进或者自制的有形动产，应缴纳增值税，可选择适用简易计税办法或一般计税方法计缴。
如E企业选择按照简易方法计税，则2012年缴纳营业税额=10×5%=0.5万元；2013年、2014年增值税销项税额=20÷（1+3%）×3%=0.58万元；企业实际得到30-0.5-0.58=28.92万元。
如E企业选择按照一般计税方法纳税，则2012年缴纳营业税额不变；2013年、2014年增值税销项税额=20÷（1+17%）×17%=2.91万元；没有相应进项税额可以抵扣，企业实际得到30-0.5-2.91=26.59万元。
三种情况比较，发现按照选择简易方法对E企业更为有利。
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