高新企业申报失败的原因方方面面，小的方面无非就是一些细节问题，如填写信息错误或者提交材料不正确等，大的方面来讲主要是以下几大类容易失分：
一、知识产权不达标
1、高新认定规定企业申报的知识产权数量须为1个I类专利或者6个II类专利，可是有的企业申请了但审核不通过，或者审核周期赶不上申报时间，如发明专利通过要1年半到3年的时间，这种情况就导致知识产权不达标。
2、有的企业本身不具备申请发明专利的能力，但碍于高新企业申报日期将近，就大量申请含金量不足的II类专利，如大量使用软件著作权，从而导致知识产权在质量审核上失分；
3、有的企业纯粹为了申报高新企业而申请知识产权，根本不理会知识产权和高新认定的关联性，如申请的一些软件著作权与研发项目和产品的关键技术完全不搭界，只是为了凑上数量要求，这就导致高新企业申报时知识产权评分不高。
二、科技成果与最终产品关联性低
1、企业科技成果与最终产品应用不一致，企业对两者之间的关联性描述也甚少；
2、科技成果转化的相关资料，如成果来源或者转化形式来源的报告分析不得当，产品与成果之间关联度不清晰，存在部分企业“强行转化”的情况，导致知识产权跟项目和产品严重不匹配，成果与产品几乎无关联，从而影响了评分。
目前对科技成果转化能力的打分是由技术专家对企业科技成果转化的总体情况进行综合评价，没有明确统一的衡量标准，企业要想得高分，只能说从评分细则入手，提高成果和最终转化产品的关联度，提高转化能力，这样进行高新企业申报时分数自然会高；
这里建议在进行高新企业申报前尽量增加科技成果总数，提供科技成果与最终转化的产品（服务）、工艺、样品、样机等在技术上存在关联性，合同、发票、检测报告等直接有力的证明；（高新认定的其他办法：/product/gxrd.html）
三、团队缺乏实操经验
1、数据显示，对于中小型企业和初次进行高新企业申报的公司来说，对具体政策和申报过程不够了解，所以导致编写申报材料经验不足；
2、团队缺乏实操经验，不清楚材料具体应该怎么准备，比如：研发人员不清楚研发项目怎么归集，缺乏科学的规划和安排，照搬专利说明书；
3、财务人员未设置研发支出辅助账，报表前后的数据不一致；没有对企业审计报表与纳税申报表不一致做出说明；科技成果佐证材料过于简单，对产品描述不清，造成专家判断认定不，影响申报结果。
高新企业申报本来讲究细节，统观全体，如果企业因种种原因而错过申报，不仅不能享受三年的税收政策还将无法享受国家的补贴，所以要记住在高新企业申报前一定要规划得当、准备充分！