1、合规性审查
审查企业的研究开发活动（项目）、年度财务会计报告和专项审计报告等是否符合《管理办法》和《工作指引》的要求；
2、独立评价
每名技术专家单独填写《高新技术企业认定技术专家评价表》，主要对企业知识产权、研究开发活动、主营业务、成果转化及高新技术产品（服务）等情况进行评价打分；每名财务专家单独填写 《高新技术企业认定财务专家评价表》，参照中介机构提交的专项报告、企业的财务会计报告和纳税申报表等进行评价打分；
3、综合评价
在各评审专家独立评价的基础上，专家组长汇总各位专家分数，按分数平均值填写《高新技术企业认定专家组综合评价表》。
注：具备条件的地区可进行网络评审。
专家库及专家选取办法
（1）认定机构应建立专家库（包括技术专家和财务专家），实行专家聘任制和动态管理，备选专家应不少于评审专家的3倍；
（2）技术专家应具有高级技术职称，并具有《技术领域》内相关专业背景和实践经验，对该技术领域的发展及市场状况有较全面的了解；财务专家应具有相关高级技术职称，或从事相关工作10年以上并具备相关职业资格；
（3）认定机构根据企业主营产品（服务）的核心技术所属技术领域从专家库中随机抽取专家组成专家组，并指定1名技术专家担任专家组组长 ，开展认定评审工作。
五、认定机构根据专家组评审意见，对申请企业申报材料进行综合评审（可视情况对部分企业进行实地核查） ，提出认定企业名单，报领导小组备案，报送时间不得晚于每年11月底。
六、经认定报备的企业名单，由领导小组办公室在"高新技术企业认定管理工作网"公示10个工作日。有异议的，须以书面形式实名向领导小组办公室提出，由认定机构核实处理；领导小组办公室可对报备企业进行随机抽查，对存在问题的企业交由认定机构核实情况，提出处理建议。
七、经认定报备的企业名单，由领导小组办公室在"高新技术企业认定管理工作网"公示10个工作日。有异议的，须以书面形式实名向领导小组办公室提出，由认定机构核实处理；领导小组办公室可对报备企业进行随机抽查，对存在问题的企业交由认定机构核实情况，提出处理建议。