间接冷却是由鼓风机将库房内的空气抽吸进空气冷却装置，空气被盘旋于冷却装置内的蒸发管吸热后，再送入库内而降温。空气冷却方式的优点是冷却迅速，库内温度较均匀，同时能将贮藏过程中产生的二氧化碳等有害气体带出库外。
疫苗冷库制冷控制系统采用全自动微电脑电气控制系统，智能电脑温度控制，高精度温度传感器，全自动温度恒温，地洞开关机，具有自动报警，无需人工操作，数码温度显示，可选配温湿度记录仪，确保库内物品存放安全。
冷库设施安全要求
（取自《冷库安全规程》 第6章 [1] ）
冷库应具备完善的消防设备，具体参见《中华人民共和国消防法》。
冷库用运输工具应符合《特种设备安全监察条例》的要求。
库房内应具备应急逃生设施。
库房内的货架应有足够的强度和刚性。
氨制冷机房内应配备防护用具和抢救药品，并放置于易获取的位置。
变配电室和具有高压控制柜的制冷机房，应配置高电压操作使用的专用工具及防护用品。
库房内应采用防潮型照明灯具和开关。
库房内灯具安装高度小于或等于2.2m时，应采用安全电压供电。灯具金属外壳均应接保护线。
低于0度的库房内动力及照明线路，应采用适合库房温度的耐低温绝缘电缆。
穿过库房隔热层的电气线路，应采取可靠的防火措施。
冷库设计应满足消防的有关规定。