当然，厂房的顶部设计也要充分考虑消防、通风、空调等设备的合理布置，其次要考虑到是否吊顶的问题，考虑到美观，不吊顶情况下一般将不美观设施做布局装饰；吊顶时则多为选择石膏板、吸音棉、铝塑板等材料。而装修风格一般为简约或现代风格。
在装修过程中经常出现有些区域要进行合理划分成不同的功能区，这样就需要用不同材料的隔断来进行分割，目前常用的隔断一般为：轻钢龙骨石膏板隔断、不锈钢玻璃隔断、铝塑板钢化玻璃隔断以及纯钢化玻璃隔断等，这些隔断都可以起到划分的作用，只是所代表的风格各异，价格也不一样，其中容易接受的便是轻钢龙骨石膏板隔断，相对来说是因造价较低。
房的建筑围护结构和室内装修，应选用气密性良好，且在温度和湿度等变化作用下变形小的材料。墙面内装修当附加构造骨架和保温层时。应采用非燃烧体或难燃烧体。
洁净室内墙壁和顶棚的表面，应符合平整、光滑、不起灰、避免眩光、便于除尘等要求;应减少凹凸面，阴阳角做成圆角。室内装修宜采用于操作;如为抹灰时，应采用高级抹灰标准。
洁净室内的密闭门宜朝空气洁净度较高的房间开启。无窗洁净室的密闭门上宜设观察窗。洁净室门窗、墙壁、顶棚、地(楼)面的构造和施工缝隙，均应采取可靠的密封措施。洁净室内的色彩宜淡雅柔和。室内各表面材料的光反射系数，顶棚和墙面宜为0.6-0.8;地面宜为0.15—0.35。