在决定无尘车间的设计之前，必须仔细考虑工厂的工作性质和气流条件。在粉尘排放量较大的无尘车间内，不要使用地面送风，以免进入其他需要清洁的工作场所。
无尘车间必须防止外界空气进入室内，室内必须保持正压才能达到目的。为了获得必要的室内压力，必须添加适当的新鲜空气。
人和物体是粉尘的主要来源，应加以控制。比如进入无尘车间，每个人都必须通过人际网络系统换上干净的衣服，接受净化系统功能的基础教育。
在无尘车间的设计过程中，根据项目的实际情况和客户的具体要求，做好以上几点。按设计方案运行的无尘车间应提供必要的给排水装置、供气装置和电源。这些装置和相关设备的设计必须易于使用，并且不会对空气净化系统造成障碍。
在无尘车间装修过程中，管道是工程的一部分。无尘车间工程所采用的保温材料应符合《防火规范》的要求，满足洁净室的需要。也就是说，无尘车间的管道保温材料和胶粘剂应选用不燃材料或阻燃材料，不应选用易扬尘的材料（如玻璃纤维、短纤维矿棉等）。在下列情况下，必须使用不燃绝缘材料。
无尘车间工人在防火墙两端2m范围内穿管、穿管、穿隔热层。根据上述需要，在洁净室工程中，经常采用拍卖保温板和复合硅酸盐保温板（防潮层和外保护材料以及与保温材料相匹配的液体泥浆），而阻燃自熄聚苯乙烯保温板不符合消防要求，限制了其应用。这里重要的是，当输送的空气温度低于环境温度时，由于隔热结构内外壁之间的温差而产生水蒸气的分压差。由于分压差的影响，管外空气中的水蒸气随热流渗入保温材料，导致保温结构内凝结，保温材料的保温性能降低，必须在保温层外设置防潮层。当气温高于环境温度时，保温结构一般不设置防潮层。保温材料采用闭孔结构，防止水汽渗入。如防水层为液体泥浆，复合硅酸盐保温板施工后无接缝。防潮效果很好，但是价格很高。