控制环境中的微尘颗粒，对药品生产企业洁净室同样重要。微尘颗粒特别是尘粒存在直接质量及寄生了微生物危及人们的生命。大量临床资料表明，如污染了7～12um的尘粒的尤其是静脉注射用药，可以导致热原反应、肺动脉炎、微血栓或异物肉芽肿等，严重的会致人死命。微尘颗粒进入血管系统对人体的危害，与粒子数量、粒径及理化性质有关。
在温度温度条件适宜的情况下，它们一昼夜可增殖10的21-24倍，因而对微生物的控制尤为重要，也更为棘手。对制药待业造成污染主要是微尘、、病毒、热原、过敏性物质。注射药如果污染了，轻则局部化脓，重则可引起全身性感染性疾病。口服及外用药除了不能有大肠杆菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌、活螨和螨卵外，对霉菌和杂菌也要进行限制。
净化车间前需要建设一定面积的缓冲区域，在人员、设备和物料进入净化车间之前需要先在缓冲区域进行初步的清洁，保证其上含有的污染物被清除，不会对车间内的环境造成负面的影响。这种缓冲区域称之为风淋车间。
当然，在潮湿的环境中人不舒服，而太过干燥的净化车间也是无法令人愉悦的。所以，在对净化车间进行工作的时候也要把握好量，在使得工作人员和设备能够不感觉潮湿的情况下也不感觉干燥才是好的净化方法。