相互有影响的生产工艺，不宜设在同一个建筑物内，当设在同一个建筑物内时，各自生产区域之间应有有效的隔断措施。生产发酵产品应具备发酵车间。
食品工业洁净用房应根据食品生产对除尘和无菌生产要求的高低分级。洁净用房应明确其中生产的关键区域，分别定级。
物品存放有序，生产所用手推车、原料和清洗工具等，在未使用时应存放在适当的区域，同时将相应区域带分类标识；
在净化车间内禁止使用非净化用品，如有必要使用，应将非净化用品置于回风附近；
检验后的成品应整齐地堆放在指定区域，用标识带做好标识，统一由出货缓冲区送出车间。
车间设备的日常管理。
由设备工程师对车间内所有设备进行相应的准备记录工作，安排定时检查，并做好详细记录；
详细的操作说明和注意事项应贴在设备的醒目位置，严禁非人员操作设备；
对某些小故障，设备工程师应在一时间给予及时维修，如有大故障，应及时联系设备制造商提供售后服务。
辐射: 电离辐射和电磁波辐射（包括紫外线[波长190～350nm]、红外线[波长0.77～1000μm]、微波[波长1～1000mm]）。
过滤:以物理的方法除去介质中的微生物。常将空气或液体中的微生物及杂质用不同材料制成的薄膜滤器过滤得到无菌、无杂质的空气或液体。滤过病毒的滤膜孔径为25 ～100nm；滤过的滤膜孔径为0.22～0.45μm。