在食用菌无尘无菌车间生产中，培养室和出菇房都需要根据蘑菇的生长需要进行通风换气，进入室外新鲜的空气，排出蘑菇生长产生的二氧化碳。
进入菇房的空气温度和湿度，会对菇房的温度和湿度产生很大的影响，室内外的差距越大，通风就更容易造成房间的环境不稳定。
在南方，夏季室外空气相对湿度较大，通风会导致菇房湿度上升，加上大多数食用菌生长温度都低于外界温度很多，高温、高湿的室外空气进入菇房会产生冷凝现象，墙壁、库板表面出现的冷凝水会滋生和霉菌。
如果这种情况出现在接种室、培养室等前段环节，就容易导致污染率上升。如果出现在出菇房，会导致蘑菇干度下降，影响货架期，甚至严重的病害。
伴随着时间的脚步，现正逐渐迈入秋季，在未来很长一段时间里，静电是很多模切厂家困扰的问题。因为静电在无尘车间中会引起电子设备故障，导致电磁干扰；促使电路和电子元件老化；吸附灰尘，降低成品率，因此在无尘车间中怕因静电原因造成故障和损耗，所以采用防静电材料进行无尘车间装修是做抗静电是基础的设计，也是有效的方法，能将无尘车间内的静电危害降到。
不仅要使无尘车间级别达标，还要有严格的管理，除了前期的防静电设计，在后期无尘车间的日常维护中车间人员穿戴，物品选用都要是防静电的。
车间围护结构
目前国内印刷包装厂净化车间较多采用夹心彩钢板结构。安装时，墙面采用企口型，而吊顶采用普通型彩钢板，使用新型“单、双”密封的夹心彩钢板配套铝型材。紧固件及管线在板材内暗装，这种方法使厂房内壁及吊顶看不到螺丝和铆钉，同时使门窗密闭程度提高，并在保健品净化车间内使用有联锁和紫外灯装置的传递窗(柜)。它能保持室内正压稳定，防止污染，达到规范要求。
车间空气过滤系统
采用空气过滤系统的新三级过滤，即：新风三级过滤(粗、中、亚过滤)；中级过滤；未端高教过滤。使得气流组织更加科学合理(能增加表冷器，中效过滤器和过滤器约1O倍的寿命) 将净化空调系统的中效过滤袋螺丝固定(不易拆装)改为压簧式固定，便于管理人员定期拆卸换洗。
车间净化空调系统
净化级别高的空间范围只能局限于设备的周围，采用局部净化技术，利用层流、吸尘、去湿等设施以减轻洁净空调负荷，达到节能目的。
在净化空调系统中使用风机调频控制技术可节能；不但系统风量基本恒定，房间压力稳定；而且风机启动平稳同时可满足值班送风要求。
5技能竖井
如果说技能夹道（墙）往往不越层，则需求越层时即用技能竖井，而且常常作为修建结构的一部分，具有性。
由于技能竖井把各层勾结起来，为了防火，内部管线安装完成后，要在层间用耐火极限不低于楼板的资料关闭，检修作业分层进行，检修门有必要设防火门。
不管技能夹层、技能夹道还是技能竖井，当直接兼作风道时，其内外表有必要按无尘车间的内外表的要求处理。
6机房方位
空调机房接近要求送风量大的无尘车间，力求风管的线路短。但从避免噪声和振动来说又要求把无尘车间与机房隔开。
7分散
由于无尘车间是密闭性很强的修建，其分散成为十分重要和突出的问题，和净化空调体系设置也有密切关系。一般应留意以下几点：
（1）每一出产层防火区或无尘区至少设2个出口，只要面积小于50㎡，人员少于5人时，可答应只设一个出口。
（2）进口不应作分散出口。由于道路往往迂回曲折，一旦焰火迷漫，要求人员很快跑到室外是很困难的事。
（3）吹淋室不能作为一般收支通道，由于这种门常为两扇联锁或主动，一旦呈现毛病，十分影响分散，所以一般均在吹淋室设旁通门，作业人员多于5人时有必要设此门。平常作业人员出无尘车间时不应走吹淋室而应走旁通门。
（4）无尘区内各无尘车间的门，考虑到保持室内压力情况的需求，其开设方向要朝向压力大的房间，由于要靠压力把门压紧，这明显和分散的要求相反。为了考虑平常无尘和紧迫分散时的两方面要求，规则无尘区和非无尘区之间的门、无尘区与室外的门作为分散门对待，其敞开方向一概朝向分散方向，当然，单设的门也是如此。