经过化粪池的酸性发酵后，其出水呈酸性，酸性污水对城市下水道有腐蚀作用。
厌氧过程产生恶臭气体，造成周围空气质量恶化，尤其在清掏过程中，恶臭气体可影响数百米远。而且容易滋生蚊蝇等，对健康和环境造成极大威胁。
为了使化粪池系统持久耐用，需要分解冲入其中的废物。加快固体降解并增加水箱中数量的一种方法是，将1/2杯干烘烤酵母冲到马桶上。酵母能促进系统所需的生长，并能分解正在慢慢充满化粪池的废物。
一般三个池的比例应该是2: 1: 3。一个池应该储存20天，二个池应该储存10天，三个池应该储存30天。化粪池的有效深度为1000毫米，较多不小于900毫米，与化粪池的上部空间相比，池深约为1150毫米。
化粪池清理的具体流程
1.用铁钩打开化粪池盖板，然后用长竹竿(8m)搅动化粪池内的杂物粘结层。
2.将真空吸粪车开到工地，将吸粪软管(长5米，3根)放入化粪池。
3.启动吸粪车的开关，将粪污吸出，直到化粪池中的溶粪块基本吸出，防止作业现场和路人的衣服弄脏。
4.盖上化粪池的井盖，用清水冲洗作业现场和所有工具。
5.化粪池一般一年布置一次，但要看化粪池的应用状况。如果用量大，需要缩短布置时间，否则会形成溢流槽。90%的一级池清理运输，75%的二级池清理运输，三级池的硬质外观完全清理运输。
6、整理后，目视井内无产品漂浮，清理出入口，防止污水溢出地面。