烘焙产品属热加工（200℃左右烘烤）糕点，欲控制烘焙产品菌落总数超标问题，需在产品烘烤后，包装前的工序中控制二次污染及交叉感染如下：
1、在生产前对设备表面、工器具、包装材料等进行表面取样检测菌落总数，平时制定严格的清洗程序，并派专人监督执行。
2、员工采用全自动免接触手部净化处理（给皂洗手——手部烘干——手部酒精），在工作过程中，每隔1小时对手部进行，即可杀灭手部也可抑制手部生长，有效控制二次交叉感染，保障食品。
3、在生产的过程中，采用高能双模净化机设备对空气,此设备可以在有人的情况下开启AIS离子净化单元、纳米光催化单元对生产车间进行，人机共处。晚上工人下班后开启臭氧发生单元对车间进行空气大，防止空气中滋生累加到白天造成对产品不利。（因一个在24小时内会繁殖成百上千甚至上百万）
4、每天班前、班后对车间内部墙壁、风机、下水道、案面、手部、围裙套袖、预冷库和库门、速冻库门、包装室、工器具间使用液喷洒，班中每2小时对风机、墙壁、下水道实施液喷洒，杀灭微生物。
5、人员的工作服、更衣室等，必须保持卫生清洁，定期清洗和进行臭氧30分钟以上，防止人为造成微生物的交叉污染（不可在有人情况下）。
6、保证车间风机的正常运转，保证车间内部空气能够达到要求指标，空调的换气程度好坏直接影响到微生物的产生。如果车间能保证及时将含有大量水份的空气排出车间，则极大程度缩小了可能存在微生物的可能性。