一、开发流程
小程序定制开发的流程考虑到用户的不同需求相对会复杂一些，开发期间的技术支持也需要相关人员的操作。而小程序模板开发较为简单，只需要付费下载模板就可以开发，但模板的功能是不能根据用户需求进行改变的。
二、开发效果
小程序定制开发的效果是根据企业商家的特点来进行定制的，因此在营销上更能很好的发挥自身的优势。而小程序模板缺乏个性，其功能效果都是统一的，但如果是要快速开发的话选择模板开发也不失为过。
三、开发费用
选择小程序定制化开发方式，无论是开发难度还是开发周期都要比模板开发更高，因为开发功能较多、开发服务比较完整等因素，由此产生的人力成本自然也更高。
四、后期维护
小程序定制开发的数据管理更完善，也更系统更高些，而且拥有开发源码以及服务器，还能进行二次开发。而模板开发则支持一些基础性和普遍性的功能，并且不能向开发者提供源码来保证数据的性以及方便二次开发。