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从马来西亚进口当归进行报关时，通常需要准备以下材料：

进口合同：与马来西亚供应商签订的当归进口合同，明确双方的权益和进口的具体细节。

装箱单和发票：详细列明当归的装箱情况、数量、价格等信息的装箱单和发票。

原产地证明：证明当归产自马来西亚的原产地证明文件。

植物检疫证书：由马来西亚相关部门出具的证明当归符合植物检疫要求的证书。

进口许可证：根据我国的进口管制要求，可能需要办理当归的进口许可证。

海关申报单：按照海关要求填写的进口货物申报单，包括当归的详细信息、价值、数量等。

其他相关证明：如果当归属于濒危物种或涉及特殊管制，可能还需要提供濒危物种进口许可证、特殊管制证明等。

同时，还需遵守我国的进口法规和标准，确保当归的质量和安全。