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注册生鲜行业营业执照的流程一般如下：
确定生鲜超市的名称和地址，并准备好房产证或租赁合同等相关资料。如果你是在自己的房屋中开设生鲜超市，需要提供房产证；如果是租赁的房屋，则需要提供租赁合同。
向工商局提交生鲜超市的工商注册申请表，并缴纳相关费用。在这个过程中，你需要提交一些必要的材料，如身份证原件和复印件、店铺的场地证明文件（房产证或土地证复印件）、租赁合同原件和复印件、证件相片一张等。如果经营范围中有属于登记前置行政许可经营项目的，还需要提交加盖印章的相关许可证件、批准文件的复印件。
等待工商局审批，审批通过后将获得工商营业执照。在这个过程中，登记机关会对申请材料进行依法审查，包括材料是否齐全、是否符合法定形式等。如果申请材料不齐全或者不符合法定形式要求，登记机关会当场告知申请人需要补正的全部内容。
在获得工商营业执照后，你还需要到当地市场监督管理局办理食品经营许可证等相关证件。在申请食品经营许可证时，你需要提交《食品经营许可申请书》、营业执照、法定代表人或负责人、经办人的身份证明原件及复印件、保障食品安全的相关制度、合法使用经营场所承诺书（包括租赁合同、场地平面图）以及与食品经营相适应的经营设备、工具清单等材料。