药品经营许可证的办理流程主要包括以下步骤：
一、准备申请材料
在申请药品经营许可证前，需要准备以下相关材料：
药品经营许可证申请表：详细填写申请信息，确保信息的准确性和完整性。
企业营业执照复印件：提供企业的合法经营证明。
企业负责人、质量负责人的身份证明、学历证明或职称证明：这些材料用于证明企业负责人和质量负责人的资质和背景。
药师或其他药学技术人员的资格证明：包括资格证书、聘书等，用于证明企业具备依法经过资格认定的药学技术人员。
经营场所、仓储设施的产权证明或租赁合同，以及平面布局图：这些材料用于证明企业具备与所经营药品相适应的营业场所、设备、仓储设施和卫生环境。
质量管理文件：包括药品质量管理制度、岗位职责、操作规程等，用于证明企业具备保证药品质量的规章制度。
保证药品质量的规章制度，以及符合药品经营质量管理规范要求的证明文件：这些文件用于证明企业符合药品监督管理部门制定的药品经营质量管理规范要求。
二、提交申请并等待审批提交申请：申请人需持有关证明材料向所在地县级以上地方人民政府药品监督管理部门提出申请。
等待审批：药品监督管理部门会对申请材料进行审核，并可能组织现场检查。检查内容主要包括经营场所、设备、仓储设施是否符合规定，是否具备保证药品质量的规章制度和质量管理机构或者人员，药师或其他药学技术人员是否在职在岗等。
三、领取药品经营许可证审核通过：如果申请符合规定条件，药品监督管理部门将颁发药品经营许可证。
领取证件：申请人可以到药品监督管理部门领取药品经营许可证，领取时需要携带有效身份证件，并签字确认领取事项。