中央空调停运后，冷却水系统和冷冻水系统的清洗可用采取单台设备清洗方式或全系统清洗方式。但无论是单台设备清洗还是全系统清洗，一般都使用清洗槽和清洗泵将单台设务或原系统(可使用原系统的水泵)构成一个闭合回路进行循环清洗。 　　清洗一般按下列程序进行。灭藻清洗、碱洗、封存、(中)钝化、碱洗后水冲洗、运行、(中和)预膜、酸洗、漂洗、酸洗后水冲洗、水冲洗(检漏)
发现情况及时修理： 中央空调是一个系统，在使用过程中如果出现不正常情况，应立即停机。应定期检查各部件，一旦发现小故障要及时处理，长时间故障运行会给中央空调带来更大的损坏，使用效果和寿命都会受到影响。
冷水机组的开、停机顺序： 要保证空调主机启动后能正常运行，必须保证： 冷凝器散热良好，否则会因冷凝温度及对应的冷凝压力过高，使冷水机组高压保护器件动作而停车，甚至导致故障。 蒸发器中冷水应循环流动，否则会因冷水温度偏低，导致冷水温度保护器件动作而停车，或因蒸发温度及对应的蒸发压力过低，是冷水机组的低压保护器件动作而停车，甚至导致蒸发器中冷水结冰而损坏设备。
常见的冷水机组故障： 1.冷水机故障：逆相报警 2.压缩机电机线圈保护开关动作 3.容调动作不正确 4.电机无法启动或 5.电机无法启动或 6.排气温度高 7.液体管道过热 8.冷凝压力过高或过低 9.蒸发压力过高或过低 10.开机时，热力膨胀阀打不开 11.膨胀阀进口管结霜 12.膨胀阀发出“咝咝”响声 13.膨胀阀供液时多时少 14.开机后，阀很快堵塞 15.膨胀阀关不小 16.制冷剂不足