简单得说，生态农业就是一个在人为控制下以农业为基础的小自然系统。他具有生物多样性、可持续性、综合性、高效性等各种优势特点。在耕种过程中需杜绝化学农药、化肥、除草剂、添加剂、农膜、转基因这农田六大害，以生物防治与物理防治来防治病虫害及田间杂草，替代所有的化学工业品。
生物防治：培育麻雀、青蛙、蜻蜓、瓢虫等农田益虫益鸟，他们会帮助我们消灭田间害虫；也可在田间放养鸡、鸭、鹅、鱼（水田），他们会帮组我们消灭田间的杂草；也可针对某种病害培育针对他的真菌，来达到治疗病害的目的。
物理防治：如在田间安设诱虫灯，诱杀可飞行的趋光性害虫；也可喷洒苦豆子、花椒等自然驱虫性植物的粉末；可借用中医的病理学对农作物病害调配中药来进行治疗；以人工除草等各种方法来达到防止病虫害与除草的目的。
人类历史上之所以没有农药化肥也能种地正是因为那时候的生态环境好，有鸟、有青蛙、有野鸭、有蜻蜓、有蚯蚓、有各种各样的田间能手。那些野生小动物虽然也或多或少吃一点粮食，但相对他们吃的虫子和草籽来说，已经是微不足道矣。
生态农业所涉及的面积越大，则越好控制，反之则难以控制。生态，顾名思义就是一个生态系统，需要多物种建立生态循环链方可称得上是生态。而耕种面积越小，物种生存空间就越小，建立完整生物链的可能性也就越小。如果千顷万顷（涵盖山地、丘陵、沼泽、湿地等非农田地）都实现了生态种植，那么一个完整的生态系统就可以建立起来了，平均消耗的人力与物力相对十亩百亩来说，那是少的多。所以说，生态农业绝对不是特殊的、个别的小农田耕种，而是越普及越好，越普及生态系统越完整；越普及生物链越丰富；越普及病虫害越少；越普及产量越高。