毛巾变硬主要是因为水中游离的钙、镁离子与肥皂结合，生成钙镁皂附着在毛巾的表面所致。为防止毛巾发硬，除了经常清洗之外，应当将毛巾放在碱水锅里煮一刻钟（一般1.5公斤水加30克纯碱即可，注意要将毛巾全部浸入碱水中），煮后将毛巾取出并用清水彻底冲洗干净。
毛巾表面油腻变黏，则是因为毛巾表面附着了大量的汗液、泪液等分泌物。清洁表面滑腻的毛巾时，除了可以采用以上的方法以外，还可以将毛巾放在浓盐水中煮或烫洗。
细菌最容易繁殖的自然条件是高温高湿，因此毛巾要经常保持干燥。但是很多家庭的卫生间没有窗户，通风条件较差，所以要想保持毛巾的清洁，应该每天用肥皂清洗一次，然后挂在太阳下晒干或在通风处晾干。每周还应该将毛巾放在盐水中煮一次。将毛巾用水浸湿后再用微波消毒也是一个很有效的杀菌方法。