很多养殖户打来电.话.询问是不是用了发酵床养猪就不能消毒了，发酵床可以消毒吗?答案是肯定的， 金宝贝干撒式发酵床上 ，消毒是完全可以，是不会杀死发酵床内的有益菌的，分解粪便效果不受影响。
之所以一般的消毒对发酵床没有明显的影响，是因为消毒.药.的剂量相对于垫料数量太小，而且垫料本身具有强大的吸附作用，使得消毒.药.不易扩散和渗透。垫料的化学作用和发酵过程的生物化学作用对消毒剂有较快的降解效果。发酵床猪舍内没有必要消毒。因为在发酵床垫料上，发酵功能菌占绝.对.优势，几乎没有病原微生物的生存空间。就是说，发酵床自身就有消毒作用。
对于 发酵床饲养的育肥猪 ，消毒的主要目的是防止猪瘟、口蹄疫、猪流感和流行性腹泻等传染性和致病性都较强的疫病传入。
猪场消毒的重点应放在与外界接触的环节上，如进出的人员、车辆以及养殖场门口等。靠消毒.药.来控制病原体在一个圈舍内的传播几乎是徒劳的。在周围有疫情威胁时应加强消毒，但在没有疫情威胁的绝大部分时间里没有必要频繁消毒。
消毒.药.如何选择
消毒剂种类繁多，该选择哪一种消毒剂，应考虑以下3种情况：
一是不同类型的病原微生物对不同类型的消毒剂有不同敏感性，尽量选择不破坏酵母菌的爱迪什、碘伏等消毒.药.进行消毒。 二是选择当地动物卫生监督检疫局经常分送给百姓使用的药物。
三是经药物对比试验，效果较好的消毒.药，如威特消毒.药.是经规模猪场消毒效果检测后，因其药效稀释倍数较大、药效较高、维持时间较长而被经常使用的一种消.毒.药.。
综上所述，正常消毒几乎不影响发酵床功能。即便杀伤力很强的消毒液，也只是对表层部分的功能微生物有影响，消毒液不会对整个发酵床数以亿万计的功能微生物造成什么彻底的威胁。对管理用药的要求，本身并不排斥发现猪患病后的药物治疗及预防用药。由于许多药物经过体内代谢已基本分解，所以正常的低剂量药物预防和治疗对发酵床不会产生太大影响。
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