1.设备应根据安装图将各箱体依次安装，箱体的位置、方向不能错，彼此间距必须准确，以便链接管道，设备安装就位后，应用绷带把设备和基础上的抗浮环连接，以防设备上浮
2.为保证设备管路畅通，应按产品说明书要求保证某些设备或管路的倾斜度。
3.设备安装后，应在设备内注入清水，检查各管道有无渗漏，对于地理式设备，在确定管道无渗漏后，在基础内注入清水30~50cm深后，即在箱体四周覆土，一直到设备检查孔，并平整地面，在链接水泵，风机等设备的电源线时，应注意风机和电机的转向。
4.设备的调试，一体化污水处理设备安装完毕后可进行系统调试，即培养调料上的生物膜，污水泵按额定的流量把污水抽入设备内，启动风机进行曝气，每天观察接触池内填料的情况，如填料上长出橙黄或呈黑色的膜，表明生物膜已培养好，这一过程一般需要7~15d。如是工业污水处理设备，先用生活污水培养好生物膜后，再逐渐进工业进行生物膜训话污水。