办理工程履约保函流程如下：

1、申请人申请开立《履约保函》，填写《保函申请表》；

2、申请人提交资料；

3、审核资料；

4、签订委托协议；

5、收取相关费用，落实保证金或者反担保并办理反担保相关手续；

6、开立《履约保函》。担保公司代办流程：

1、提供被担保企业资料、工程项目的相关资料和一些签约资料并递交给担保公司；

2、担保公司审批；

3、落实少量的保证金，走银行审批流程。法律依据：《建设工程施工合同》第四十一条 发包人承包人为了履行合同，应互相提供以下担保：发包人向承包人提供履约担保，按合同约定支付工程价款；承包人向发包人提供履约担保，按合同约定履行自己的各项义务。