查询保函文件的真实性的方式如下：

1、银行保函文件上有保函号码。当事人可以不需要去银行，可以直接使用文件上的银行联系方式，致电联系；

2、银行保函可以拨打银行的客服电话，转人工，查询保函落款银行电话，再次致电保函开出行，查询保函的真实性；

3、工程保函通办理的所有保函在平台可在线查询。