亲子鉴定古已有之，三国时期便有滴血验亲记载，通过血液是否渗入骨骸或两血相融判断亲缘，然缺乏科学依据，准确性极低。

20 世纪 30 年代，血型测试登场，依孟德尔遗传定律，借 ABO 血型等推测亲子关系，可排除部分父权，但因基因多样性与突变，可靠性有限。

1953 年 DNA 双螺旋结构发现，为亲子鉴定奠定基础。20 世纪 80 年代，限制性片段长度多态性（RFLP）技术出现，使遗传分析进入 DNA 水平，然操作复杂、耗时长。

1985 年，英国亚力克・杰弗里发明 DNA 指纹图谱技术，借 DNA 微卫星结构的独特性鉴定亲缘，广泛用于刑侦与血亲鉴定，如 “9・11” 事件中鉴别遇难者身份。

20 世纪 90 年代中期，STR（短串联重复序列）技术兴起，成主流方法。其通过 PCR 扩增特定序列，结合毛细管电泳分析，具操作简、灵敏度高、样本少等优势，准确率超 99.99%。1996 年美国 FBI 建立 CODIS 数据库，推动全球数据共享。

我国早期用 HLA 分型，2000 年后 STR 技术成熟，从刑事案件走向民事领域，在落户、遗产继承等方面发挥重要作用。